自动化分拣系统的分拣作业可分为三大类：自动分拣机分拣、机器人分拣和自动分类输送机分拣。
自动分拣机分拣系统自动分拣机，一般称为盒装货物分拣机。是药品配送中心常用的一种自动化分拣设备。这种分拣机有两排倾斜的放置盒状货物的货架，架上的货物用人工按品种、规格分别分列堆码；货架的下方是皮带输送机；根据集货容器上条码的扫描信息控制货架上每列货物的投放；投放的货物接装进集货容器，或落在皮带上后，再由皮带输送进入集货容器。
自动分拣系统当供应商或货主通知配送中心按订单发货时，自动分拣系统在短的时间内 可从庞大的存储系统中准确找到要出库的商品所在的位置，并按所需数量、品种、规格出库。自动分拣系统一般由识别装置、控制装置、分类装置、输送装置组成，需要自动存取系统(AS/RS)支持。
自动分拣系统的作业过程可以简单描述如下：物流中心每天接收成百上千家供应商或货主通过各种运输工具送来的成千上万种商品，在短的时间内将这些商 品卸下并按商品品种、货主、储位或发送地点进行快 速准确的分类，将这些商品运送到地点(如的货架、加工区域、出货站台等),同时，当供应商或货主通知物流中心按配送指示发货时，自动分拣系统在短的时间内从庞大的高层货架存储系统中准确 找到要出库的商品所在位置，并按所需数量出库，将从不同储位上取出的不同数量的商品按配送地点的不 同运送到不同的理货区域或配送站台集中，以便装车配送。
自动分拣系统一般由识别装置、控制装置、分类装置、 输送装置和分拣道口组成。识别装置通过条形码扫描、色码扫描、重量检测、语音识别、高度检测及形状识别等方式，利用LAN、总线技术或RF技术将分拣要求传给分拣控制装置。 控制装置的作用是识别、接收和处理分拣信号，根据信号指示分类装置和输送装置进行相应的作业。分类装置接受控制，当具有同类分拣信号的商品经过该装置时，能够改变其运行方向使其进入其他输送机或分拣道口输送装置起输送作用。分拣道口一般由钢带、皮带、滚筒等组成滑道，使货物脱离主输送机滑向集货区域的通道，后入库或组配装车进行配送。
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